花菖蒲は日本の山野に自生するノハナショウブをもとに、江戸時代中期以降に積極的な改良が行われ発達を遂げた伝統園芸植物で　日本人の美意識がそのまま花に表れているという点で、数ある園芸植物のなかでも稀有な花であり、現存する品種数は2.000種以上あります。

　当園では、品種の保存・改良・育種を積極的の進め、現在20万株・600種を超える。しかし、風雨や性質が弱いもの、花菖蒲園に向かないものも多く、景観を重視した品種選びに努めています。

■熊本花菖蒲（肥後系）
松平菖翁より譲り受けた品種をもとに、江戸時代末期から肥後藩士らによって改良が進められた品種群。
　肥後六花の一つとして豪華さの中にゆるぎない品格を備えた花は、武士道精神の表れであり、まさに武士（もののふ）の花である。鉢で作り、室内に陳列して観賞した。戦後一般に普及、改良され「肥後系」と呼ばれる系統となった。

■伊勢（松坂）花菖蒲
江戸末期の紀州藩士、吉井定五郎により作出され、その後も松坂地方の少数の人々によってまもり、伝えられてきた系統。
戦後は「伊勢系」と呼ばれ広く一般に普及した。
　伊勢菊、伊勢撫子とともに「伊勢三珍花」と呼ばれ、この地方の好みで、垂れ咲きの三英花が特徴である。男性的な熊本花菖蒲に対し、繊細で女性的な美しさに溢れる。